More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0915 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  678    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  34.12 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  35.22 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  31.99 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  32.65 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  29.52 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  31.01 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  31.01 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  28.78 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  30.3 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  31.3 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  29.18 
 
 		 370 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  29.05 
 
 		 356 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  29.96 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  36.14 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  35.15 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  35.15 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  27.17 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  34.02 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  29.96 
 
 		 372 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  28.68 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  32.24 
 
 		 395 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  38.82 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  31.78 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  32.7 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  28.7 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  28.53 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  30.15 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  33.7 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  25.43 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.44 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  28.87 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  32.68 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  30.69 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  28.44 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  29.15 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.16 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  29.28 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  28.14 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  27.72 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  27.72 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.96 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  26.61 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.5 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  30.29 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.26 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  30.26 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.26 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  32.45 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  27.61 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  27.83 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.37 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  28.11 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  28.86 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.45 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  26.59 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.51 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.79 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.79 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.79 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.79 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.62 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  22.55 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  22.78 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.2 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  23.64 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.97 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.2 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.96 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.2 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  30.77 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.2 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.94 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.2 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.5 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.08 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  29.52 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.94 
 
 		 665 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  26.38 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  25.07 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  21.92 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  21.92 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  21.92 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  21.92 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  21.92 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  21.92 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  21.92 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  21.92 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  25.53 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  30.3 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  24.4 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>