More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5210 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
345 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  55.36 
 
 
344 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  55.07 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  44.15 
 
 
372 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  44.09 
 
 
349 aa  289  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  45.19 
 
 
340 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  43.73 
 
 
379 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  46.67 
 
 
347 aa  275  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  42.27 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  43.71 
 
 
382 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  42.4 
 
 
336 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  43.59 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  43.3 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  36.78 
 
 
387 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  45.91 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  32.07 
 
 
359 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  34.53 
 
 
360 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  30.58 
 
 
358 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  30.85 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  35.36 
 
 
359 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  31.44 
 
 
347 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  31.81 
 
 
347 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  29.55 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  29.74 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  34.33 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  32.21 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  27.89 
 
 
349 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
372 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 
364 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  28.23 
 
 
340 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  27.89 
 
 
340 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  36.22 
 
 
379 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  28.84 
 
 
350 aa  99.4  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  31.34 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  29.19 
 
 
329 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 
383 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  29.8 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  26.85 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.36 
 
 
349 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  28.43 
 
 
368 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  25.76 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  27.75 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  31.44 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.87 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  29.44 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  27.16 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  27.24 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  26.27 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.29 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  28.93 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  28.93 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  21.86 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  26.32 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  29.57 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  25.72 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.5 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.31 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.15 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.96 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.96 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.57 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  21.53 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  21.81 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  25.87 
 
 
529 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.93 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  21.81 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.19 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  22.34 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22.15 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  21.14 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  21.14 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  21.14 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  30.23 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  21.14 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  24.44 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  25.07 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.62 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.05 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.56 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.11 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.28 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  24.27 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  24.32 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  26.56 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.59 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  30.05 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.66 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.56 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  23.73 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.07 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  24.26 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  23.05 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  23.05 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  23.05 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  23.05 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.5 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  23.05 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  23.05 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>