More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3369 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  99.13 
 
 
344 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
344 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  55.65 
 
 
345 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  50.58 
 
 
349 aa  325  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  44.19 
 
 
379 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  43.6 
 
 
372 aa  295  6e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  46.33 
 
 
340 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  47.2 
 
 
347 aa  285  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  45.63 
 
 
382 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  43.06 
 
 
344 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  45.09 
 
 
345 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  44.8 
 
 
345 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  42.73 
 
 
336 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  40.83 
 
 
387 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  44.19 
 
 
357 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  35.39 
 
 
359 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  33.88 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  33.43 
 
 
358 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  34.55 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  32.78 
 
 
347 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  34.84 
 
 
359 aa  153  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  33.33 
 
 
347 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  31.95 
 
 
347 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  29.97 
 
 
347 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  31.06 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  31.56 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  30.75 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  34.93 
 
 
359 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 
372 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  31.74 
 
 
356 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  30.22 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  28.04 
 
 
340 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  29.45 
 
 
349 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  32.31 
 
 
333 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 
376 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.04 
 
 
341 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  32.14 
 
 
370 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  31.88 
 
 
329 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 
383 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  29.55 
 
 
329 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  27.95 
 
 
365 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  24.16 
 
 
381 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 
529 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  27.94 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  28.24 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  27.31 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 
436 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  25.67 
 
 
395 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.47 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  33.68 
 
 
381 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.42 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  35.63 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.67 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.39 
 
 
354 aa  89.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  30.39 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  30.39 
 
 
401 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  26.2 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  30.39 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  26.69 
 
 
443 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.71 
 
 
354 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  32.1 
 
 
346 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.66 
 
 
389 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.38 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  27.21 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.84 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.85 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.41 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.41 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.37 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.22 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.33 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  22.37 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  22.37 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  27.05 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  25.34 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  27.07 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  27.59 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  25.34 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  26.33 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  21.69 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  21.69 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  21.69 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  21.69 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2750  hypothetical protein  27.8 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.28 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.32 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.32 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.32 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.83 
 
 
404 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.32 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.32 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.32 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>