More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07191 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_07191  permease  100 
 
 
359 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  59.38 
 
 
358 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  58.24 
 
 
358 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  58.94 
 
 
360 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  53.8 
 
 
359 aa  312  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  45.48 
 
 
347 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  44.97 
 
 
347 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  45.77 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  44.48 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  53.56 
 
 
359 aa  272  7e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  39.67 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  38.36 
 
 
387 aa  232  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  39.72 
 
 
382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  38.83 
 
 
347 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  37.46 
 
 
344 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  36.24 
 
 
372 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  39.11 
 
 
345 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  38.83 
 
 
345 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  38.02 
 
 
336 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  36.31 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  35.73 
 
 
349 aa  189  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  34.08 
 
 
344 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  34.08 
 
 
344 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  52.6 
 
 
357 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  31.72 
 
 
345 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 
372 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  30.12 
 
 
329 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  29.7 
 
 
349 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  29.7 
 
 
350 aa  119  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  27.54 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  27.54 
 
 
340 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  31.71 
 
 
329 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  26.9 
 
 
340 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  27.22 
 
 
356 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.45 
 
 
381 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  29.22 
 
 
333 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 
376 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  31.46 
 
 
370 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  23.35 
 
 
381 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  25.43 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  29.5 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  33.15 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  25.76 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  30.64 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  23.58 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  25.52 
 
 
395 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 
395 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
529 aa  85.9  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  27.23 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  28.37 
 
 
606 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  24.49 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.76 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  26.1 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  32.28 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.62 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  29.75 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25.07 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  24.18 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.15 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  26.64 
 
 
649 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  28.95 
 
 
652 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  24.64 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  28.95 
 
 
652 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.92 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.98 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  29.19 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.94 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.15 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  24.08 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2589  hypothetical protein  24.12 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148207  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.52 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  29.73 
 
 
675 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  25 
 
 
644 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.36 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  27.94 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.83 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  28.95 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  30.82 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  21.79 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  26.42 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  25.21 
 
 
663 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  25.57 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  24.53 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  22.87 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  29.02 
 
 
700 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25 
 
 
373 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  31.09 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  28.33 
 
 
679 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.76 
 
 
435 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  23.13 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  28.33 
 
 
668 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  26.65 
 
 
665 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>