More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2235 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  767    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  67.01 
 
 		 382 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  60.66 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  61.52 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  60.15 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  63.59 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  50.99 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  43.47 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  45 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  42.06 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  42.33 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  41.67 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  33.61 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  31.25 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  31.06 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  30.75 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  28.18 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  35.71 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  32.3 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  29.19 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  35.29 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  28.32 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  28.06 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  34.87 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  34.33 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  27.06 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  26.12 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  24.79 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  22.59 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  32.94 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  25.75 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.06 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  27.98 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  25.32 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  27.13 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  26.92 
 
 		 668 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.5 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  26.92 
 
 		 679 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.64 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.68 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  27.81 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  23.9 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  24.01 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  24.45 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  30.11 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.99 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  27.31 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  29.1 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  30.52 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.36 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  26.95 
 
 		 675 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  29.44 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.07 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.16 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 344 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  30.06 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  26.63 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  25.7 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  28.14 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 		 336 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  23.25 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  24.83 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  24.5 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  25.56 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  26.59 
 
 		 606 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.27 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  27.68 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  29.17 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  25.95 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  22.86 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  35.29 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  22.78 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  26.94 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  22.91 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.11 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  26.24 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  31.58 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  28.4 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.49 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.6 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.32 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  28.49 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.4 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  22.58 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.87 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  28.14 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  31.65 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.51 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  22.3 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  23.6 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>