More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0209 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 399 aa  770    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  38.48 
 
 		 408 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  41.59 
 
 		 414 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  41.88 
 
 		 364 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  35.19 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  34.27 
 
 		 455 aa  192  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  35.88 
 
 		 563 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  33.72 
 
 		 526 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  36.59 
 
 		 448 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  31.17 
 
 		 529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  31.31 
 
 		 373 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.09 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  33.44 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.44 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  32.1 
 
 		 436 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  28.54 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  29.11 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  28.95 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  32.21 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.53 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  29.39 
 
 		 435 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  29.94 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 486 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  29.96 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  29.78 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  30.42 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 363 aa  90.1  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.96 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.03 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  30.12 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.03 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  30.54 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.57 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  28 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  29.96 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  29.96 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  30.1 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25.87 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  29.72 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  26.74 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  27.14 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  27.93 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.26 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  27.79 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.24 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  28.1 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  25.56 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  25.61 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  24.8 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  30.42 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.72 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.67 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  28.4 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  28.37 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  27.78 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  27.78 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  27.78 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.12 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  26.8 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.99 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.23 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  29.05 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.52 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  30.03 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  28.95 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.15 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.15 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.15 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.15 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  31 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.15 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  27.53 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.15 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.15 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.52 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.15 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.75 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  27.37 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.15 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.44 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  27.48 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.08 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.18 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  27.85 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  23.28 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  34.81 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.23 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>