More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3832 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 372 aa  724    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  40.72 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  36.45 
 
 		 350 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  34.66 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  34.95 
 
 		 340 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  32.87 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  31.66 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  35.48 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  35.48 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  35.1 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  28.32 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  29.66 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  30.37 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  29.06 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  30.15 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  28.49 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  31.34 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  27.65 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  31.14 
 
 		 372 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  39 
 
 		 346 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  41.71 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  31.53 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  37.57 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.89 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  30.06 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.85 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  30.15 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  28.83 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  36.78 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  30.46 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  25.93 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  36.93 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  27.18 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  29.04 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.73 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  35.91 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  33.87 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  28.11 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  38.04 
 
 		 359 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  29.97 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  35.8 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  30.05 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  28.45 
 
 		 381 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.48 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  29.11 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.11 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  29.11 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.11 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  30.99 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.11 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.97 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  28.17 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  33.5 
 
 		 649 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.13 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  34.1 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  32.2 
 
 		 652 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.78 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 652 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.97 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  29.78 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  32.2 
 
 		 652 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  32.89 
 
 		 372 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  32.8 
 
 		 645 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  32.93 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.63 
 
 		 383 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.27 
 
 		 368 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  32.49 
 
 		 347 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  38.92 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  31.2 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  23.12 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  30.57 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  31.67 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  30.81 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  21.71 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  29.11 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  36.81 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  21.71 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.12 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  33.7 
 
 		 487 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28.26 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  36.91 
 
 		 647 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  19.75 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  29.37 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.1 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>