More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0061 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  731    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  31.82 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  31.9 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  31.9 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  31.9 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  31.9 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  31.99 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  31.9 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  31.29 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  29.55 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  32.18 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  31.29 
 
 		 355 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  28.48 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  31.73 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  31.87 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  30.91 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  31.29 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  28.42 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  28.42 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  28.42 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  28.42 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.11 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  28.08 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  28.82 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  28.08 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  28.08 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  28.08 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.42 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  28.08 
 
 		 361 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  28.08 
 
 		 361 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  38.71 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  32.64 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.84 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.14 
 
 		 402 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.14 
 
 		 402 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  29.55 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.55 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  37.18 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  29.01 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  29.59 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.82 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  28.33 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  29.36 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.17 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.38 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  28.69 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  26.59 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.88 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.07 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.41 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  28.01 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.3 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.02 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  27.03 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.93 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  27.36 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  23.12 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25.67 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  27.36 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  28.28 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  26.02 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.54 
 
 		 529 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  33.1 
 
 		 384 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  32.35 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  25.71 
 
 		 373 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.39 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  25.71 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  25.71 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  25.71 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  24.45 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.71 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  28.28 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  28.07 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.73 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.92 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  31.72 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.08 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.2 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  32.06 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.72 
 
 		 349 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  29.79 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  30.45 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.15 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  31.02 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  27.24 
 
 		 487 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.33 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  24.33 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  24.33 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  24.33 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  24.33 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  24.33 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  24.33 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>