More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2262 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  727    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  65.25 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  65.25 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  63.83 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  58.92 
 
 		 353 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  46.07 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  42.15 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  45.28 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  45.03 
 
 		 379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  44.85 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  43.73 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  43.38 
 
 		 368 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  36.62 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  34.86 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  37.06 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  35.95 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  33.51 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  36.76 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  29.39 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  31.79 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  37.56 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  32.92 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  28.12 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  27.62 
 
 		 372 aa  116  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  27.5 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  25.14 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  28.09 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  28.57 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  23.38 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  38.92 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  23.48 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  29.73 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  36.71 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  29.79 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  28.82 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  25.64 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  31.93 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  31.22 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  23.81 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  26.44 
 
 		 344 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  31.93 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  21.83 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  22.65 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  28.1 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  31.48 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  29.29 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  20.9 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.64 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.67 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.16 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  30.3 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  26.9 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.52 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  31.98 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  26.53 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  31.98 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  28.57 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  28.57 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  28.57 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  28.57 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  28.57 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.38 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.23 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.37 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  28.73 
 
 		 358 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  28.74 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  26.83 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  26.61 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.4 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  34.93 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  25.67 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  25.67 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  27.34 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  27.34 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  27.34 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.66 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  31.5 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  24.21 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  23.49 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.49 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.05 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.51 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  28.42 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>