More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1751 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  58.64 
 
 		 381 aa  358  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  57.68 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  58.19 
 
 		 401 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  58.41 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  47.26 
 
 		 382 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  50.3 
 
 		 368 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  49.71 
 
 		 383 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  46.78 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  48.97 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  46.84 
 
 		 391 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  45 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  39.32 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  34.56 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  33.72 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  38.41 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  38.08 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  34.1 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  34.88 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  35.87 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  37.37 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  29.39 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  29.94 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  29.64 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  26.25 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  26.76 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.29 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  37.57 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  33.56 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  27.14 
 
 		 372 aa  95.9  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.12 
 
 		 371 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  25.84 
 
 		 358 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  28.99 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  35.2 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  30.04 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  29.41 
 
 		 358 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  25.97 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  33.13 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.07 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.31 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  34.57 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  23.55 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  27.27 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  33.15 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  25.97 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.65 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.65 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.65 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.65 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  24.75 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  25.97 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  26.1 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.28 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  26.4 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.97 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.28 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.56 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.28 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  28.51 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.28 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  28.49 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.28 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  28.2 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  29.48 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  29.48 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  31.4 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  29.48 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  29.48 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.82 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  30.13 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  29.48 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  32.48 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  27.13 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  27.15 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  27.15 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.72 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  27.31 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  24.21 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  26.21 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  26.34 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  26.34 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  26.34 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  26.34 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  27.38 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  27.17 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  32.87 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>