More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1787 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
392 aa  741    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  99.49 
 
 
401 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  89.53 
 
 
395 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  65.17 
 
 
381 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  59.23 
 
 
353 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  41.87 
 
 
395 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  41.03 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  39.68 
 
 
382 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  42.55 
 
 
368 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  39.73 
 
 
391 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  42.06 
 
 
395 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  41.62 
 
 
379 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  33.97 
 
 
364 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  35.82 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  35.4 
 
 
340 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  46.51 
 
 
340 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  32.28 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  46.05 
 
 
340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  33.83 
 
 
369 aa  119  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  30.16 
 
 
346 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  36.54 
 
 
370 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  27.7 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  41.92 
 
 
346 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 
376 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  24.09 
 
 
359 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.98 
 
 
349 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  31.22 
 
 
358 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  33.15 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  29.96 
 
 
358 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  31.58 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  36.71 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  34.34 
 
 
329 aa  90.1  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  30.81 
 
 
372 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  27.68 
 
 
355 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  28.87 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.23 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  22.89 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  37.26 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  30.98 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  34.34 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  29.51 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  29.07 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  30.23 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  29.07 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  34.27 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.35 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.69 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.69 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.69 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.69 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.79 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.38 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  32.11 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  38.51 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  37.56 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.14 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.14 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.14 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  37.96 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  37.86 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  30.98 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  26.67 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.86 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.86 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.19 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  33.12 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  30.93 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  31.18 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.05 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  31.18 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  36.89 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  28.25 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.41 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  33.16 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  30.94 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.92 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  32.72 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  27.69 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  22.65 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  28.16 
 
 
362 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.34 
 
 
354 aa  67  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  28.16 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  28.16 
 
 
362 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  28.16 
 
 
362 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  28.16 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  25.28 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  23.12 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  34.98 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  29.59 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.44 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  37.58 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  29.1 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  25.83 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>