More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09400 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  100 
 
 		 357 aa  694    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  45.09 
 
 		 529 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  44.35 
 
 		 423 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  45.09 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  42.77 
 
 		 387 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  39.02 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  41.43 
 
 		 436 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  39.89 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  36.39 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  41.29 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  37.32 
 
 		 486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  38.62 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  33.79 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  35.71 
 
 		 400 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  35.02 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  35.04 
 
 		 406 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  32.94 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  38.3 
 
 		 440 aa  123  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  31.66 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.67 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  26.86 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  31.71 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  30.67 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  29.01 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  28.75 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  32.72 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  28.61 
 
 		 415 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.26 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.62 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  27.12 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  28.78 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.1 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  35.29 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  35.4 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.9 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  33 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  25.74 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  33.85 
 
 		 369 aa  92.8  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 438 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.77 
 
 		 344 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  26.07 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  26.75 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  34.17 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  24.67 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.62 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  28.79 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  29.03 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  30.74 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  29.87 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.92 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  25.63 
 
 		 526 aa  89.7  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.99 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.16 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.16 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  32.93 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  30.81 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  31.03 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.54 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.85 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  28.44 
 
 		 460 aa  87  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  22.37 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  33.78 
 
 		 487 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.04 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.76 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  32.03 
 
 		 422 aa  86.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  29.52 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  25.66 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.12 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.57 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  31.32 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  29.36 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  32.22 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  33.77 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  28.44 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.66 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  26.81 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.06 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.5 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  33.79 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.81 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.81 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  31.53 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>