More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2596 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  81.55 
 
 		 436 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  39.24 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  39.89 
 
 		 357 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  50.54 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  33.88 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  37.08 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  32.97 
 
 		 443 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  35.38 
 
 		 486 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  32.43 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  34.49 
 
 		 412 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  31.08 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 392 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  34.2 
 
 		 406 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 		 394 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  32.14 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  34.36 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.56 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.88 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.93 
 
 		 423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  31.6 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  30.72 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.44 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  29.9 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  31.96 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.69 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.69 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.62 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  29.87 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  27.8 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  27.57 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  24.64 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.92 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.4 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.17 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.68 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.18 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  29.22 
 
 		 457 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.17 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.17 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.17 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.17 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.17 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 397 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.17 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.53 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  24.41 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.23 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  25.62 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.83 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.86 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  25.97 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.86 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  29.76 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  28.84 
 
 		 563 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 444 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  26.77 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  33.47 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.93 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  30.49 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  25.71 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  27.97 
 
 		 416 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  30.36 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 		 452 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.3 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.74 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.76 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  26.96 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.42 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  26.21 
 
 		 403 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.88 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  29.17 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  24.49 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  27.65 
 
 		 372 aa  86.3  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  28.43 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.01 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  28.01 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.7 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.09 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  26.92 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  26.01 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  23.15 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.36 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  24.52 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  26.35 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  22.42 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>