More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0195 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 486 aa  940    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  39.47 
 
 		 529 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  40.76 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  40.16 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  39.11 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  41.26 
 
 		 387 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  35.5 
 
 		 443 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  36.2 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  35.88 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  37.32 
 
 		 357 aa  192  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  35.38 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  37.72 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  35.09 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  30.36 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  37.37 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  28.71 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 		 358 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.34 
 
 		 354 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.43 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.24 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 		 397 aa  103  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.98 
 
 		 396 aa  99.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.37 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.92 
 
 		 405 aa  93.2  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.17 
 
 		 341 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  29 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.11 
 
 		 348 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  24.12 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  24.23 
 
 		 526 aa  91.3  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  26.45 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  30.15 
 
 		 422 aa  89.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  35.17 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  26.92 
 
 		 363 aa  87.8  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  24.73 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.87 
 
 		 364 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.02 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  25.72 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  25.52 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  32 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.44 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  30.65 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  25.66 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  27.08 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  30.77 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.16 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1434  hypothetical protein  23.3 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.46 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.46 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1480  hypothetical protein  23.3 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  23.35 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.68 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  25.49 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.67 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  28.96 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  25.91 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  25.52 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.24 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  26.53 
 
 		 357 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  27.7 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.07 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.13 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.22 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  30.34 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  23.81 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25.47 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  25.08 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  30.5 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  23.62 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.47 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22.79 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2477  hypothetical protein  27.84 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.93 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  26.17 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  23.93 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.97 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  23.8 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  30.14 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  29.22 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  28.68 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.78 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  26.33 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  26.33 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  28.27 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  26.33 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  23.89 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  24.93 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  22.55 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  22.47 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.33 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>