More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1608 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  44.44 
 
 
412 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  45.16 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  39.08 
 
 
529 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  43.7 
 
 
443 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  41.78 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  42.22 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  38.08 
 
 
486 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  36.96 
 
 
392 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  35.79 
 
 
388 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  37.5 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  33.16 
 
 
394 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  32.14 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  33.61 
 
 
436 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 
400 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  36.45 
 
 
406 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  34.06 
 
 
358 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  36.76 
 
 
397 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  31.95 
 
 
373 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  34.65 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 
354 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  31.89 
 
 
399 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.41 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.41 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.41 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.41 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.41 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.41 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.41 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.41 
 
 
355 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.96 
 
 
371 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.22 
 
 
361 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.22 
 
 
361 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.22 
 
 
348 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.22 
 
 
361 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.22 
 
 
361 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.22 
 
 
361 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.9 
 
 
373 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.9 
 
 
348 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.9 
 
 
361 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.29 
 
 
414 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.9 
 
 
361 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.19 
 
 
361 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 
353 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.74 
 
 
355 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  31.76 
 
 
487 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.76 
 
 
408 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  30 
 
 
387 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.85 
 
 
369 aa  99.4  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.47 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.41 
 
 
356 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.5 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.05 
 
 
370 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.51 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  28.35 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  26.06 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  23.15 
 
 
526 aa  94  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  26.38 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  27.53 
 
 
448 aa  92.8  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  30.72 
 
 
423 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.69 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.31 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.42 
 
 
354 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  26.71 
 
 
563 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.58 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.82 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  31.43 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  31.43 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  24.36 
 
 
364 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 
386 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  31.43 
 
 
381 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.42 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  25.35 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  28.28 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  29.9 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.62 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  30.51 
 
 
384 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.55 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 
417 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  23.81 
 
 
377 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  27.59 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  28.67 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.07 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  22.71 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  29.74 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  26.39 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.39 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  28.04 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  29.82 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  27.41 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.22 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.14 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.6 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.22 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>