More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1485 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 455 aa  908    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  64.05 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  58.13 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  55.52 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  44.83 
 
 		 563 aa  343  5e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  44.32 
 
 		 526 aa  323  4e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  37.81 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  40.13 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  36.26 
 
 		 386 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  34.27 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.51 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  24.57 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.71 
 
 		 373 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  27.9 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  28.29 
 
 		 367 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  28.67 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  33.47 
 
 		 423 aa  97.1  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.24 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  29.78 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.33 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.24 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.67 
 
 		 361 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  25.99 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.67 
 
 		 361 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  26.82 
 
 		 413 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  29.57 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  27.55 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.24 
 
 		 361 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.24 
 
 		 361 aa  90.9  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.24 
 
 		 348 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.96 
 
 		 348 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.24 
 
 		 361 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.24 
 
 		 361 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  28.22 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  28.31 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  24.48 
 
 		 486 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  28.31 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  28.31 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  28.28 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 351 aa  87.8  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.67 
 
 		 398 aa  87.4  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  29.6 
 
 		 423 aa  87  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  27.78 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  28.61 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.58 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  25.77 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  23.48 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  26.38 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  27.81 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.59 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  27.81 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  21.36 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  22.75 
 
 		 394 aa  83.2  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.32 
 
 		 349 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.96 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  27.38 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  24.92 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  27.21 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.8 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.3 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.02 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.67 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.33 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  26.64 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.33 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  23.89 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.31 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.46 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.63 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  24.49 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  23.87 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  25.95 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  25.71 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  28.28 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  23.99 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  24.84 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  23.4 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  24.45 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.08 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  24.76 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  25.84 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  25.61 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  29.55 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  27.19 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2801  hypothetical protein  23.44 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  28.44 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25.49 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>