More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  100 
 
 		 477 aa  925    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  49.45 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  40.79 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  47.01 
 
 		 421 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  44.83 
 
 		 455 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  38.15 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  43.02 
 
 		 483 aa  239  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  43.1 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  44.06 
 
 		 439 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  45.53 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  41.67 
 
 		 423 aa  223  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  37.08 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  39.34 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  37.98 
 
 		 384 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  36.24 
 
 		 381 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  36.16 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  36.16 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  38.64 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  37.54 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  39.35 
 
 		 405 aa  196  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  37.54 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  37.98 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  35.49 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  42.17 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  38.53 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  32.79 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 		 416 aa  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  29.51 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  32.53 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  33.07 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  31.33 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  34.93 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  31.3 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  34.15 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  34.49 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  32.76 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  34.33 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  34.05 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  33.05 
 
 		 476 aa  120  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 368 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  35.15 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  34.89 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  34.89 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  34.89 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  33.23 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  32.02 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.21 
 
 		 415 aa  96.7  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  30.37 
 
 		 355 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  30.5 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  29.84 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  29.05 
 
 		 399 aa  91.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.61 
 
 		 358 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.96 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.71 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  30.94 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.36 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  30.71 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.6 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.7 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.02 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.48 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.02 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.08 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.9 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.9 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.9 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.02 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.35 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.85 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.9 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.71 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.71 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.85 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.39 
 
 		 665 aa  73.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  22.97 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  30.58 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.29 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.77 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.62 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  29.2 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.43 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.71 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.1 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  22.17 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  24.67 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  23.66 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.48 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  23.68 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.65 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>