More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  100 
 
 		 436 aa  852    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  64.21 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  58.14 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  57.43 
 
 		 368 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  44.38 
 
 		 392 aa  259  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  37.31 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  35.44 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  35.49 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  36.53 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  36.53 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  36.53 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  37.18 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  37.08 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  37.54 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  34.15 
 
 		 457 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  37.23 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  35.95 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  34.97 
 
 		 452 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  36.86 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36.06 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  36.18 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  34.38 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  34.84 
 
 		 483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  34.69 
 
 		 390 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  34.72 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.21 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  36.11 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  33.66 
 
 		 439 aa  166  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  32.04 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  33.65 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  37.16 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  36.15 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  27.99 
 
 		 477 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  26.25 
 
 		 435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  37.46 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.07 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  34.05 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  31.53 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  33.92 
 
 		 367 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  37.86 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  33.64 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  28.84 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  29.33 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  32.18 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  32.7 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  29.75 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  38.38 
 
 		 355 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  30.07 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  30.19 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  38.61 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 		 529 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  30.25 
 
 		 376 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  29.66 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  29.66 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.6 
 
 		 343 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.76 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  30.24 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.35 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.21 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.18 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.28 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.73 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  29.26 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  25.61 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.58 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  22.83 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.19 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  28.44 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.82 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  24.42 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  30.4 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.94 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.43 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  27.86 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  35.82 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  25.94 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.41 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.41 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.71 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  26.75 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  30.77 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  33.94 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  24.64 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.1 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  30.86 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  25.4 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.3 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  30.29 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.09 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  24.32 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  28.05 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>