More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2026 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
398 aa  771    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  65.48 
 
 
436 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  58.4 
 
 
418 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  53.2 
 
 
368 aa  325  7e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  47.88 
 
 
392 aa  272  8.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  35.47 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.15 
 
 
452 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  36.36 
 
 
421 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  36.02 
 
 
464 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  35 
 
 
381 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  35 
 
 
381 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  35 
 
 
381 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  34.15 
 
 
487 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  35.12 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  36.42 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  36.51 
 
 
389 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  37.5 
 
 
457 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  36.87 
 
 
420 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  39.71 
 
 
455 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.99 
 
 
387 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  36.11 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36.36 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  37.2 
 
 
367 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  35.83 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  36.46 
 
 
421 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  33.63 
 
 
415 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  36.44 
 
 
483 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  38.27 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  31.51 
 
 
429 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  36.93 
 
 
403 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  36 
 
 
393 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.56 
 
 
435 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  30.34 
 
 
477 aa  149  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  34.82 
 
 
439 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  38.28 
 
 
475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  37.01 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  36.92 
 
 
405 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  30.65 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.13 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  29.64 
 
 
367 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  30.93 
 
 
444 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  30.32 
 
 
441 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  31.66 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 
416 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  31.4 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  33.1 
 
 
394 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  31.23 
 
 
390 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  43.75 
 
 
389 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  29.89 
 
 
414 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  32.66 
 
 
376 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  32.66 
 
 
376 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  32.43 
 
 
376 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  29.79 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.27 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 
529 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.79 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.49 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.49 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.49 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.49 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.49 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.57 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.5 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.11 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.17 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.27 
 
 
355 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  29.82 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.14 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.72 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  24.56 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.86 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.27 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.03 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  31.01 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  29.14 
 
 
414 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05090  predicted permease  26.61 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.114877  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.55 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.6 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  25.58 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.62 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  27.52 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.77 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  24.53 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.77 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.29 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.09 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  24.78 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  23.18 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.98 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  25.48 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.69 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.98 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  29.19 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>