More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4482 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
390 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  54.64 
 
 
383 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  55.16 
 
 
381 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  55.16 
 
 
381 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  54.62 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  55.33 
 
 
384 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  53.27 
 
 
367 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  51.3 
 
 
487 aa  296  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  49.74 
 
 
402 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  51.01 
 
 
423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  51.28 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  43.82 
 
 
457 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  46.86 
 
 
421 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  43.89 
 
 
420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  44.22 
 
 
421 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  42.61 
 
 
464 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  42.54 
 
 
455 aa  248  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  50.44 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  44.9 
 
 
452 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  45.59 
 
 
439 aa  238  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  40.56 
 
 
483 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  40.9 
 
 
415 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  40.23 
 
 
429 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  38.51 
 
 
477 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  46.22 
 
 
396 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  38.42 
 
 
405 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  38.2 
 
 
367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  37.87 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  36.28 
 
 
436 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  34.73 
 
 
407 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.58 
 
 
387 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.58 
 
 
397 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.83 
 
 
441 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  36.48 
 
 
368 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.2 
 
 
398 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  35.29 
 
 
426 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  35.94 
 
 
444 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  39.62 
 
 
384 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  36.46 
 
 
423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.32 
 
 
435 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  33.14 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  38.16 
 
 
432 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  39.41 
 
 
414 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  37.79 
 
 
394 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  36.71 
 
 
376 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  36.96 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  36.69 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  35.62 
 
 
376 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  35.62 
 
 
376 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  32.19 
 
 
416 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  31.34 
 
 
476 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.77 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  33.45 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.85 
 
 
371 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.12 
 
 
358 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  31.84 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.77 
 
 
529 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.92 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  31.45 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.26 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.97 
 
 
355 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 
438 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.32 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.32 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.32 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.32 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.32 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  31.59 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.27 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.27 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  31.13 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.69 
 
 
436 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
408 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  27.3 
 
 
355 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.69 
 
 
388 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.69 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.05 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  29.94 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  27.08 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.77 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  32.08 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  27.63 
 
 
563 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  20.66 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  20.66 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.1 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  31.49 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  25.85 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  29.94 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  25.22 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  28.47 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.44 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.93 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  28.98 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.54 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  20.99 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.7 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>