More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2803 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 441 aa  851    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  52.44 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  44.12 
 
 		 355 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  32.67 
 
 		 383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  35.34 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  31.99 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.93 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  36.59 
 
 		 423 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  33.14 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  32.95 
 
 		 381 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  32.53 
 
 		 457 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  32.95 
 
 		 381 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  32.95 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  33.24 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  34.49 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  33.23 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  36.36 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  38.25 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  35.33 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  30.68 
 
 		 477 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  34.68 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  30.03 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  33.73 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  37.09 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  35 
 
 		 389 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  35.63 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  32.23 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  32.93 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  36.22 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  35.56 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  36.14 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  34.56 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  31.61 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  32.15 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  33.43 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  31.16 
 
 		 394 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  33.01 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  29.23 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  32.18 
 
 		 376 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  29.33 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  32.83 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  31.31 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  31.31 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  30.33 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  29.13 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  32.61 
 
 		 384 aa  103  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  30.55 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  31.56 
 
 		 393 aa  99.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  33.84 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  35.86 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  30.46 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.2 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.75 
 
 		 665 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  23.95 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  24.85 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  24.07 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.06 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  25.24 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  24.46 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  26.38 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.63 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.36 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  22.32 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  26.8 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  23.87 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.76 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  29.49 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  26.64 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.94 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  25.8 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.9 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  20.47 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  30.8 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  26.88 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.08 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.25 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.08 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.25 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.25 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.25 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.08 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.25 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.63 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  23.58 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  24.26 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>