More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1050 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 384 aa  709    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  53.03 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  53.99 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  53.26 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  41.04 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  39.35 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  40.99 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  39.53 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  39.8 
 
 		 487 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  39.94 
 
 		 464 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  40.4 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  38.54 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  40.07 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  40.07 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  40.07 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  41.81 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  38.13 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  40.07 
 
 		 367 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  39.62 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  37.26 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  40.94 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  38.11 
 
 		 452 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.57 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  36.1 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  42.12 
 
 		 475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  38.52 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  37.93 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  37.02 
 
 		 436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  42.62 
 
 		 483 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  39.66 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  37.97 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  35.74 
 
 		 407 aa  156  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  37.12 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  36.55 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  38.83 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  38.74 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  38.83 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.21 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  32.7 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  35.47 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  38.36 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  41.26 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  38.68 
 
 		 476 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  36.9 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  34.19 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  35.19 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  37.1 
 
 		 396 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  36.27 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.78 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.11 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.81 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  36.45 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  37.76 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  38.19 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  31.9 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 529 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.3 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.62 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  30.6 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.6 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.38 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.81 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.95 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.6 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.6 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  28.26 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.6 
 
 		 348 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  28.49 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  24.84 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  31.88 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.75 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.5 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.53 
 
 		 368 aa  93.6  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  27.7 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  27.7 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  27.7 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.7 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.78 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  24.52 
 
 		 368 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  24.52 
 
 		 368 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  24.38 
 
 		 368 aa  92.8  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.42 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  23.6 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.7 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  31.27 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.42 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  29.7 
 
 		 424 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 354 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.35 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.39 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.31 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  28.1 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>