More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6257 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 389 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  35.04 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  33.91 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  39.41 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  39.41 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  35.67 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  36.05 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  35.57 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  33.79 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  37.58 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  34.08 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  34.08 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  36.02 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  33.85 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  31.71 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  34.29 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  37.86 
 
 		 390 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  39.82 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  37.38 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  34.29 
 
 		 415 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  32.26 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.87 
 
 		 452 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  31.47 
 
 		 439 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  34.63 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  36.75 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  33.63 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  32.37 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  39.82 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  38.02 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.97 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  35.11 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  30.57 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  41.97 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  32.95 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  40.78 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  34.46 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  37.16 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  33.14 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  31.62 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  29.51 
 
 		 477 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  33.43 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  36.99 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  36.54 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  44.39 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  44.63 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36.21 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  30.38 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  28.29 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  32.61 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  28.06 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  32.18 
 
 		 414 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.39 
 
 		 358 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.91 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.54 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.6 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.6 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.78 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.56 
 
 		 341 aa  89.7  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  27.74 
 
 		 355 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  27.74 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  31.56 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  27.74 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  31.55 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  27.74 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  27.74 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.31 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  32.99 
 
 		 542 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.31 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  34.43 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  31.68 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  22.79 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  26.99 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.03 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.03 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.03 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  30.3 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  38.25 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.16 
 
 		 348 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  22.52 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  22.52 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  22.52 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  22.52 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  22.52 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.84 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.16 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  37.27 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>