More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1387 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 369 aa  700    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  30.42 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  30.11 
 
 		 376 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  30.11 
 
 		 376 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  30.58 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  29.72 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  28.32 
 
 		 464 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  29.75 
 
 		 487 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 		 483 aa  93.6  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  28.05 
 
 		 455 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  29.74 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  30.31 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  31.16 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 441 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  30.33 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  30 
 
 		 429 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  31.79 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  29.37 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  27.13 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  29.2 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  28.88 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.06 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  29.83 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  26.9 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  29.93 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  29.28 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  28.61 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  28.36 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  27.3 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  30.41 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  30.88 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  28.96 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  28.96 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  28.96 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  27.11 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  31.62 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  37.93 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.03 
 
 		 452 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.03 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.03 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  34.76 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.13 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.03 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.77 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  27.8 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.03 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  25.83 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.03 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.57 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.03 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  20.92 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  22.73 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  32.69 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.73 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.73 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.73 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  26.65 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  26.57 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  29.03 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  25.94 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  26.39 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  26.39 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  22.73 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  28.14 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  26.39 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  27.04 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  29.52 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.17 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  25.2 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  25.86 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  26.4 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05090  predicted permease  26.4 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.114877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  26.42 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  26.97 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  21.24 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.53 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.66 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  28.22 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.47 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  26.91 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  26.87 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  24.13 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  19.88 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.38 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  23.01 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  22.13 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  35.85 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.42 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  19.75 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  20.62 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>