More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2806 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
387 aa  747    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  72.7 
 
 
389 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  50.55 
 
 
397 aa  332  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  52.45 
 
 
384 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  40.61 
 
 
383 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  40.76 
 
 
464 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  41.27 
 
 
381 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  40.55 
 
 
487 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  41.27 
 
 
381 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  38.76 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  41.27 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  43.01 
 
 
367 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  40.43 
 
 
384 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  40.75 
 
 
421 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  42.27 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  41.64 
 
 
415 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  40.87 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  42.21 
 
 
376 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  42.21 
 
 
376 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  41.64 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  38.58 
 
 
390 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  41.18 
 
 
455 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  38.21 
 
 
436 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  38.55 
 
 
457 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  40.13 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  38.58 
 
 
398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  37.92 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  35.51 
 
 
429 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  38.39 
 
 
426 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.04 
 
 
418 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  42.34 
 
 
475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  38.36 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  43.24 
 
 
402 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  41.13 
 
 
483 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  42.81 
 
 
403 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  38.15 
 
 
444 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  37.38 
 
 
441 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  36 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  36.33 
 
 
407 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  37.58 
 
 
452 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  39.05 
 
 
423 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  38.56 
 
 
416 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  38.17 
 
 
393 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  34.78 
 
 
435 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  40.47 
 
 
476 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  41.08 
 
 
390 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  34.45 
 
 
477 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  41.2 
 
 
396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  45.5 
 
 
405 aa  146  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  37.07 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  35.46 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  34.9 
 
 
392 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  36.78 
 
 
355 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  31.45 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  32.39 
 
 
358 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  29.24 
 
 
376 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  29.24 
 
 
373 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  29.24 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  29.24 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  29.24 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  28.95 
 
 
373 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.53 
 
 
373 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  29.33 
 
 
376 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  29.36 
 
 
373 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  29.36 
 
 
373 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.39 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  31.53 
 
 
529 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 
400 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  30.41 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.48 
 
 
412 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.82 
 
 
390 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.05 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  29.9 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  29.9 
 
 
358 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  29.07 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  32.89 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  32.75 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  25.81 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.81 
 
 
361 aa  86.3  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  28.97 
 
 
363 aa  86.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.61 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  25.6 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  26.57 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  29.9 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 
344 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.78 
 
 
402 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.78 
 
 
402 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.59 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.42 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.81 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  34.87 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.81 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25.71 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>