More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  100 
 
 		 403 aa  775    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  58.87 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  50.28 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  50.96 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  50.96 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  48.97 
 
 		 390 aa  315  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  51.82 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  50 
 
 		 487 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  52.25 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  50.14 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  49.18 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  49.25 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  43 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  43.69 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  44 
 
 		 452 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  54.52 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  43.52 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  45.45 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  46.71 
 
 		 420 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  39.04 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  44.18 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  35.52 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  43.28 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  42.93 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  40.36 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  45.21 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  35.4 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  35.48 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  44.72 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  36.75 
 
 		 436 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  38.03 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  42.02 
 
 		 444 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  38.8 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  36.75 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  40.62 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  41.98 
 
 		 387 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  35.29 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.93 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  36.75 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  38.23 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  36.31 
 
 		 394 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.03 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  36.67 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  37.96 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  37.07 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  37.81 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  37.81 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  38.49 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  41.82 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  34.91 
 
 		 441 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  32.04 
 
 		 476 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.63 
 
 		 355 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  34.24 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  33.44 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  41.95 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  32.85 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25.78 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.63 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  24.62 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.44 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  27.85 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  27.45 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  27.01 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  28.5 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  31.65 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 		 356 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.33 
 
 		 329 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.41 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  25.5 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  25.5 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  28.84 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  28.22 
 
 		 606 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.89 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.89 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.89 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.89 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.89 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.86 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.86 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 		 649 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.94 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.7 
 
 		 343 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.8 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 344 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  29.69 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25.9 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.53 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 		 652 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  24.79 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  27.35 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.05 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.61 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.15 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  29.21 
 
 		 438 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>