More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2128 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 444 aa  847    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  48.99 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  47.68 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  52.29 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  50 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  46.62 
 
 		 423 aa  286  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  48.07 
 
 		 394 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  50 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  50 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  48.06 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  41.67 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  37.08 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  37.07 
 
 		 464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  35.48 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  37.61 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  35.62 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  35.62 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  35.34 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  38.34 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  36.47 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  35.84 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  38.89 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.52 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  38.27 
 
 		 367 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  36.48 
 
 		 487 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  36.25 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  41.46 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  40.36 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.78 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  36.14 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  41.11 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  37.25 
 
 		 423 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  38.21 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  42.82 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36.55 
 
 		 402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  36.56 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  36.62 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  32.83 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  36.3 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  34.97 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  37.99 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  32 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  36.84 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  32.83 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  28.86 
 
 		 429 aa  136  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.33 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  36.79 
 
 		 384 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  35.71 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  31.45 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  36.24 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  31.63 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  29.61 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  29.78 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  40.85 
 
 		 389 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 368 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.38 
 
 		 343 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  32.43 
 
 		 563 aa  110  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.89 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.26 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  31.61 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 		 354 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  29.41 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.39 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.24 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  30.25 
 
 		 392 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.13 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  30.08 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  27.47 
 
 		 371 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  29.32 
 
 		 364 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  29.17 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.01 
 
 		 529 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 		 349 aa  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  26.97 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.3 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  32.03 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.48 
 
 		 383 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.97 
 
 		 353 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  30.54 
 
 		 357 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.4 
 
 		 348 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.46 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.4 
 
 		 361 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.4 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.4 
 
 		 361 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.4 
 
 		 361 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.54 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  24.05 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  27.9 
 
 		 354 aa  86.7  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.4 
 
 		 348 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.4 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.4 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.05 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.4 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  26.5 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.73 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  28.19 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.28 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>