More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1700 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  837    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  41.09 
 
 
464 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  42.9 
 
 
415 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  43.77 
 
 
407 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  39.34 
 
 
487 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  39.3 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  40.23 
 
 
390 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  38.44 
 
 
381 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  38.44 
 
 
381 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  39.09 
 
 
383 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  39.58 
 
 
381 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  42.86 
 
 
432 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  37.13 
 
 
367 aa  202  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  36.42 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  38.48 
 
 
384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  37.61 
 
 
368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  34.15 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  34.66 
 
 
421 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  34.73 
 
 
402 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  31.73 
 
 
452 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  36.03 
 
 
397 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  36.6 
 
 
403 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  35.69 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  32.89 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  37.57 
 
 
396 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  32 
 
 
455 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  31.39 
 
 
436 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  35.51 
 
 
387 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  34.09 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  34.08 
 
 
389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  37.46 
 
 
475 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  30.81 
 
 
483 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 
398 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  32.9 
 
 
405 aa  150  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  35.48 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  31.33 
 
 
477 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  31.93 
 
 
367 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  30.15 
 
 
426 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.21 
 
 
435 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  33.13 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  32.07 
 
 
376 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  31.88 
 
 
394 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  32.61 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 
444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  32.61 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  31.34 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.29 
 
 
423 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  33.81 
 
 
393 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  30.21 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  29.13 
 
 
441 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
358 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  31.81 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  31.69 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  37.62 
 
 
389 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 
416 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.46 
 
 
345 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  31.55 
 
 
355 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  31.64 
 
 
373 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 
354 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.06 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.55 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 
389 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.17 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.62 
 
 
529 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  29.65 
 
 
455 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.69 
 
 
373 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.69 
 
 
361 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.69 
 
 
348 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.93 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.93 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.38 
 
 
361 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.38 
 
 
361 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.38 
 
 
361 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.38 
 
 
348 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.56 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.38 
 
 
361 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  28.52 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.39 
 
 
368 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.77 
 
 
361 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  29.19 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.69 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  24.76 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  33.53 
 
 
563 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  29.73 
 
 
414 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.8 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.67 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.23 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.48 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.32 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  25.99 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>