More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1161 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  796    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  81.53 
 
 		 464 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  47.56 
 
 		 487 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  46.7 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  45.54 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  41.67 
 
 		 429 aa  255  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  43.43 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  45.07 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  45.07 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  45.07 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  41.85 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  44.94 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  40 
 
 		 457 aa  246  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  43.66 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  43.27 
 
 		 439 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  38.28 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  41.67 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  41.84 
 
 		 421 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  42.81 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  42.59 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  40.9 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  42.39 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  41.47 
 
 		 483 aa  213  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  41.94 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  40.87 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  37.24 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  36.57 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  43.28 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  37.39 
 
 		 405 aa  186  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  39 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  32.63 
 
 		 426 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.12 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  41.26 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  36.31 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.38 
 
 		 418 aa  176  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  40.2 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  36.64 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  37.73 
 
 		 476 aa  169  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.94 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  33.71 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  42.04 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  42.04 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  36.64 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.91 
 
 		 423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  37.2 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  40.38 
 
 		 384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  38.22 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  32.58 
 
 		 416 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.47 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  31.14 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  33.9 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  36.31 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.05 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  37.73 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.69 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  32.03 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.72 
 
 		 343 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 363 aa  96.3  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.72 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.11 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.72 
 
 		 379 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.61 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 358 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  30.68 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.87 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  25.71 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.57 
 
 		 370 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  25.68 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.08 
 
 		 354 aa  90.1  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  27.1 
 
 		 353 aa  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.86 
 
 		 348 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  30.26 
 
 		 374 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.07 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.55 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.55 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  30.45 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.61 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.05 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  28.71 
 
 		 372 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  26.75 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.24 
 
 		 363 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  28.9 
 
 		 366 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.79 
 
 		 436 aa  86.7  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.79 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.79 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.55 
 
 		 348 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.79 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.64 
 
 		 371 aa  87  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.37 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  27.95 
 
 		 360 aa  86.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.01 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  28.25 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>