More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2637 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
421 aa  808    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  62.2 
 
 
420 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  59.23 
 
 
455 aa  398  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  55.74 
 
 
483 aa  355  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  45.45 
 
 
457 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  47.01 
 
 
477 aa  292  9e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  52.14 
 
 
439 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  45.09 
 
 
383 aa  275  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  45.33 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  45.33 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  48.54 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  45.33 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  47.51 
 
 
423 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  46.04 
 
 
384 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  46.86 
 
 
390 aa  262  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  44.82 
 
 
452 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  42.25 
 
 
464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  42.47 
 
 
421 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  40.78 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  46.27 
 
 
396 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  44.02 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  42.35 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  47.37 
 
 
475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  40.87 
 
 
415 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  41.9 
 
 
405 aa  201  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  37.85 
 
 
407 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  36.39 
 
 
436 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  39.24 
 
 
367 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  34 
 
 
429 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.23 
 
 
423 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.54 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.8 
 
 
397 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  33.13 
 
 
368 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  40.19 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  35.58 
 
 
441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  35.03 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  34.45 
 
 
416 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  36.19 
 
 
389 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.36 
 
 
387 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 
418 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  36.28 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  39.17 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  40 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  42.69 
 
 
376 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  42.69 
 
 
376 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  37.22 
 
 
384 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  35.63 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  33.8 
 
 
476 aa  139  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  35.44 
 
 
414 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.89 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  37.08 
 
 
432 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  37.13 
 
 
393 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.25 
 
 
363 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.57 
 
 
390 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
358 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.07 
 
 
402 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.07 
 
 
402 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  35.1 
 
 
389 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  30.86 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.55 
 
 
354 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.93 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 
351 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  26.5 
 
 
329 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 
529 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.06 
 
 
343 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.4 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.24 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.37 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.81 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.37 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.81 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.73 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.39 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.73 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.37 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  26.43 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.1 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.43 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.37 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 
417 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  25.22 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.32 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.77 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.19 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  30.75 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.19 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.27 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  29.92 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.48 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  28.11 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>