More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1252 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  99.47 
 
 
376 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  99.47 
 
 
376 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  716    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  84.35 
 
 
394 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  61.97 
 
 
426 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  58.87 
 
 
414 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  53.43 
 
 
390 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  49.86 
 
 
444 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  50.9 
 
 
476 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  44.77 
 
 
416 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  43.4 
 
 
423 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.64 
 
 
397 aa  208  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  35.82 
 
 
383 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  37.09 
 
 
464 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  38.27 
 
 
439 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  43.33 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  34.1 
 
 
487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  34.71 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  34.71 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  34.71 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  38.27 
 
 
457 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  41.03 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  38.31 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.39 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  36.73 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  32.95 
 
 
423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  41.05 
 
 
475 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  34.6 
 
 
367 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  37.54 
 
 
415 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  38.19 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  34.99 
 
 
390 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  34.44 
 
 
367 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  30.38 
 
 
407 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  35.75 
 
 
403 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36.52 
 
 
402 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  43.31 
 
 
421 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 
384 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  37.4 
 
 
483 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  33.11 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  37.71 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.32 
 
 
435 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  33.44 
 
 
421 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  32.67 
 
 
441 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  40.31 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  34.23 
 
 
432 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  31.94 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  36.43 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  39.41 
 
 
389 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  31.58 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25 
 
 
371 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  31.18 
 
 
477 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  32.66 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.1 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  30.84 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  29.29 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 
354 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.96 
 
 
438 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.53 
 
 
390 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.49 
 
 
361 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.79 
 
 
361 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.79 
 
 
361 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.79 
 
 
361 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 
358 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.79 
 
 
348 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.49 
 
 
361 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.49 
 
 
361 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.49 
 
 
373 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.49 
 
 
348 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.49 
 
 
361 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.68 
 
 
392 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.49 
 
 
361 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.73 
 
 
369 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.94 
 
 
354 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 
408 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.41 
 
 
370 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.26 
 
 
371 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  30.85 
 
 
369 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  28.09 
 
 
418 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
460 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.59 
 
 
393 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  28.41 
 
 
369 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.74 
 
 
351 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 
388 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  24.65 
 
 
386 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.26 
 
 
368 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.85 
 
 
398 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  27.09 
 
 
455 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 
436 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  26.8 
 
 
412 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.7 
 
 
399 aa  96.3  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  23.97 
 
 
345 aa  95.9  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  30.3 
 
 
563 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  30.47 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  28.78 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.1 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.48 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  26.87 
 
 
412 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 
429 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>