More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1098 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 396 aa  748    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  46.73 
 
 		 452 aa  288  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  44.36 
 
 		 457 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  46.36 
 
 		 423 aa  285  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  46.63 
 
 		 487 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  48.7 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  48.8 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  44.31 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  44.3 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  40.89 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  46.94 
 
 		 483 aa  259  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  43.47 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  43.56 
 
 		 421 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  46.2 
 
 		 421 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  41.44 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  41.44 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  41.44 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  50.3 
 
 		 475 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  43.42 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  42.61 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  41.88 
 
 		 415 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  41.76 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  41.81 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  43.96 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  36.39 
 
 		 429 aa  209  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  42.4 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  39.76 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  40.19 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  36.81 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  40.25 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  35.56 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.82 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.46 
 
 		 418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  38.91 
 
 		 423 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 		 426 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  33.74 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  38.56 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  36.78 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.95 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  35.28 
 
 		 394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  33.59 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.89 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  40.12 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  33.65 
 
 		 416 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  34.13 
 
 		 476 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  34.87 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  34.87 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.93 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.16 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  36.56 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  32 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  41.54 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.22 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  30.81 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  26.91 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.77 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.07 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 		 354 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.19 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.26 
 
 		 436 aa  93.6  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.61 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.9 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.83 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.42 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  32.46 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.61 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.33 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.33 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.89 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.89 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.33 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.25 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  24.6 
 
 		 329 aa  90.9  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.8 
 
 		 348 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  25.38 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.62 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  29.05 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.32 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.49 
 
 		 348 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  35.36 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  28.53 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  25.08 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  35.36 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  25.92 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  21.49 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  25.08 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  25.08 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.61 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.61 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.61 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.61 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.61 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  34.81 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.87 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.61 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  26.88 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>