More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4850 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  758    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  86.46 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  84.76 
 
 		 376 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  84.76 
 
 		 376 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  61.13 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  57.73 
 
 		 414 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  57.85 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  48.42 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  51.06 
 
 		 476 aa  276  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  44.79 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  40.85 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.05 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  36.58 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  39.27 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  36.47 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  33.99 
 
 		 487 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  36.86 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  33.89 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  40.41 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  37 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.69 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  39.94 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  36.12 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  33.43 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  35.95 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  34.22 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  34.22 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  34.22 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  40.85 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  37 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  37.23 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  35.98 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  35.85 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  32.28 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  33.04 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  38.29 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  37.64 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  39.41 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  35.85 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  35.45 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  32.67 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.05 
 
 		 435 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  36.2 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  35.31 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  39.08 
 
 		 393 aa  136  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  33.14 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  32.43 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  32.53 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.14 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  32.52 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  32.13 
 
 		 436 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  37.59 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.22 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.02 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 		 438 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.34 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.96 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.96 
 
 		 370 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.33 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  30.67 
 
 		 563 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.71 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.65 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.33 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.99 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.33 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.66 
 
 		 343 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  29.44 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.02 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.65 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.65 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.33 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.63 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  26.65 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.65 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.33 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.33 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.72 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  24.32 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  29.57 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  26.75 
 
 		 329 aa  96.7  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.35 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  26.41 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 436 aa  93.6  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.88 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.63 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  30.05 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>