More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1881 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  837    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  56.4 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  45.1 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  33.25 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  36.01 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  33.42 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  35.42 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  32.52 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  32.52 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  32.8 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  32.86 
 
 		 384 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  32.77 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  31.22 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  31.55 
 
 		 421 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  30 
 
 		 477 aa  155  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  31.59 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  32.82 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  31.52 
 
 		 464 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  30.45 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  31.61 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  31.03 
 
 		 455 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  31.2 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  31.65 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  34.43 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  28.61 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  34.78 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  32.71 
 
 		 367 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  32.02 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  35.57 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  34.8 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  30.28 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  34.02 
 
 		 420 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  30.47 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  31.21 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  32.2 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  30.62 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  30.1 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  31.16 
 
 		 394 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  30.84 
 
 		 376 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.44 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  34.56 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  32.83 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 444 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  32.45 
 
 		 414 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  33.46 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.79 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  32.81 
 
 		 384 aa  99.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  28.83 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  37.37 
 
 		 393 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.88 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  27.46 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  26.77 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  25.68 
 
 		 529 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  25.34 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  23.95 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  27.85 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.13 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.69 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  28.09 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  23.66 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.96 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.25 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.71 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.25 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.25 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.25 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.25 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  28 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.25 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.96 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.09 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.96 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  31.38 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.78 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.15 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.15 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.15 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.15 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.15 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  25.95 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  26.74 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.85 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  27.08 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.8 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>