More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2556 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
429 aa  860    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  45.97 
 
 
492 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05090  predicted permease  45.38 
 
 
405 aa  346  4e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.114877  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 
460 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.97 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.99 
 
 
361 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.2 
 
 
373 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.66 
 
 
361 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.66 
 
 
361 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  29.07 
 
 
361 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.66 
 
 
361 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  29.25 
 
 
361 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  28.73 
 
 
348 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.27 
 
 
348 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.72 
 
 
354 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  29.18 
 
 
423 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.78 
 
 
345 aa  104  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.28 
 
 
405 aa  103  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.6 
 
 
355 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.6 
 
 
355 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.6 
 
 
355 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.6 
 
 
355 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.6 
 
 
355 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.6 
 
 
402 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.6 
 
 
402 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.3 
 
 
355 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 
373 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 
529 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.9 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.98 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  23.37 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.53 
 
 
349 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.93 
 
 
383 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.1 
 
 
438 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  25.98 
 
 
375 aa  89  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.19 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.07 
 
 
417 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  25.71 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 
400 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.28 
 
 
355 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.43 
 
 
392 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 
345 aa  86.3  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  28.88 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  29.35 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.71 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.8 
 
 
435 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.32 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  22.9 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  26.75 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  25.82 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.81 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  26.76 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  26.5 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.59 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  25.43 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.69 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.38 
 
 
351 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  23.12 
 
 
378 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  24.68 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.49 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.62 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.21 
 
 
351 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  24.32 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.86 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  24.27 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  25.29 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  24.5 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  24.91 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.77 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.07 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  24.55 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.29 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  28.11 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  21.09 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  21.14 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  26.45 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  26.25 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.6 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  25.58 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  23.68 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  26.39 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  24.79 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  25.56 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  26.77 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  26.54 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  33.14 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  31.58 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>