More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3407 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  793    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  81.08 
 
 		 407 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  47.45 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  38.17 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  42.13 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.82 
 
 		 363 aa  136  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  30.64 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.82 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.27 
 
 		 418 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  29.56 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  28.86 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.45 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  29.71 
 
 		 665 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.62 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.35 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.61 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.21 
 
 		 343 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.89 
 
 		 341 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.87 
 
 		 355 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.13 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.96 
 
 		 378 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.86 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.86 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.97 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.5 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.32 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  27.55 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.49 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.86 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.55 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.55 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.21 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  28.48 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  32.43 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  32.43 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 		 349 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.69 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  30.1 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  24.22 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  31.53 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.05 
 
 		 349 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  26.33 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.62 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  23.82 
 
 		 354 aa  103  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.17 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  28.65 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  28.88 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  27.27 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  28.77 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  28.44 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.07 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  28.33 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  29.55 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  26.82 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  26.1 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  27.38 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.87 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  28.03 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.6 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.6 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  25.07 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.19 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.55 
 
 		 356 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.69 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 		 361 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  23.78 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.52 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  27.88 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  26.85 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  29.97 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  29.39 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.55 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  24.78 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  23.3 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22.22 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  26.83 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  28.25 
 
 		 370 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.85 
 
 		 529 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 370 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  27.98 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>