More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0071 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
435 aa  852    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.53 
 
 
363 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.66 
 
 
378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.79 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  23.12 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.69 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.43 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  23.1 
 
 
388 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.12 
 
 
341 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.12 
 
 
404 aa  126  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.8 
 
 
396 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.26 
 
 
344 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  25.22 
 
 
382 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.61 
 
 
405 aa  123  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  25.51 
 
 
374 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.05 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.05 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.68 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.44 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.61 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  25.14 
 
 
418 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.31 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.33 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  28.61 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.46 
 
 
355 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.46 
 
 
355 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.46 
 
 
355 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.46 
 
 
355 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.46 
 
 
355 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.06 
 
 
374 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.48 
 
 
354 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.32 
 
 
379 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  26.84 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.38 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.38 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  23.16 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  22.73 
 
 
356 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  24.74 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  25.21 
 
 
370 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 
370 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  26.11 
 
 
382 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.84 
 
 
370 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  21.79 
 
 
356 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  22.81 
 
 
361 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.33 
 
 
438 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.64 
 
 
417 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  26.11 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  23.62 
 
 
665 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  22.16 
 
 
356 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.34 
 
 
371 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  24.15 
 
 
365 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  21.6 
 
 
353 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  22.31 
 
 
358 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  21.92 
 
 
347 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  21.92 
 
 
347 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.77 
 
 
355 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24 
 
 
349 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  23.46 
 
 
364 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 
353 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 
374 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  26.45 
 
 
362 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  21.7 
 
 
360 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 
351 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  22.7 
 
 
358 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  22 
 
 
375 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  22.78 
 
 
383 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  23.17 
 
 
357 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.69 
 
 
392 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 
370 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  26.59 
 
 
373 aa  103  9e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  23.16 
 
 
368 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  22.65 
 
 
357 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  21.64 
 
 
357 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  20.83 
 
 
357 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  20.55 
 
 
357 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  21.97 
 
 
389 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  20.54 
 
 
357 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  22.13 
 
 
357 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.78 
 
 
369 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.34 
 
 
349 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  23.46 
 
 
356 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  21.64 
 
 
354 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  23.05 
 
 
382 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  25.79 
 
 
407 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  23.38 
 
 
356 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  22.16 
 
 
452 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  23.08 
 
 
345 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  25.62 
 
 
355 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  25.61 
 
 
368 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  23.33 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  23.82 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  25.22 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  25.95 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  22.25 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  25.95 
 
 
376 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  25.95 
 
 
376 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  25.95 
 
 
376 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.95 
 
 
373 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  23.46 
 
 
434 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>