More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3424 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  798    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  49.72 
 
 
386 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  38.42 
 
 
438 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  43.85 
 
 
407 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  38.86 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  30.15 
 
 
361 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  30.15 
 
 
361 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  30.15 
 
 
373 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  29.85 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  29.85 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  30.15 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  29.85 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  30.15 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.85 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.06 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  29.44 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  30.15 
 
 
361 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.16 
 
 
363 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  28.31 
 
 
361 aa  136  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 
354 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 
368 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.04 
 
 
405 aa  127  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 
435 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.67 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.76 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  27.35 
 
 
418 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 
389 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.87 
 
 
341 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  34.81 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  26.3 
 
 
345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.64 
 
 
368 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.53 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.5 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.53 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.17 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 
361 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.45 
 
 
351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.32 
 
 
355 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  28.38 
 
 
452 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.11 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.07 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.09 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.95 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  27.54 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  29.04 
 
 
357 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  27.05 
 
 
379 aa  110  5e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 
364 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  23.34 
 
 
368 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  28.48 
 
 
329 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  28.35 
 
 
360 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.68 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.68 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.68 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.68 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  29.9 
 
 
394 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.68 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 
358 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.34 
 
 
372 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  27.38 
 
 
370 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 
374 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.29 
 
 
398 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.26 
 
 
378 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.85 
 
 
349 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.06 
 
 
374 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.14 
 
 
415 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 
374 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.37 
 
 
355 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.37 
 
 
355 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.48 
 
 
375 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  27.51 
 
 
357 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.48 
 
 
358 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  26.98 
 
 
357 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.4 
 
 
357 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  29.05 
 
 
357 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  28.96 
 
 
357 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 
429 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.8 
 
 
345 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  28.4 
 
 
357 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  28.57 
 
 
354 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.5 
 
 
348 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 
360 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 
370 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  27.73 
 
 
425 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.04 
 
 
349 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.92 
 
 
373 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.73 
 
 
365 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.79 
 
 
434 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  26.99 
 
 
366 aa  101  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 
375 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.49 
 
 
424 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  26.8 
 
 
356 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  25.46 
 
 
356 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 
356 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  26.5 
 
 
382 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  24.35 
 
 
339 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  25.29 
 
 
377 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>