More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1556 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  794    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  81.08 
 
 		 407 aa  611  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  48.25 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  43.85 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  36.34 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.2 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.11 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  30.75 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.46 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.25 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  30.09 
 
 		 665 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.78 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  27.11 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  28.06 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.61 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.37 
 
 		 368 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  28.07 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.81 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  27 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.28 
 
 		 345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.89 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  30.35 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  28.41 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.93 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.93 
 
 		 357 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.93 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  26.12 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.43 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.81 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  29.82 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.6 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.13 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.13 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.13 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.13 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.13 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  26.09 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.27 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  27.14 
 
 		 452 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  29.04 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  27.2 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.49 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.49 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  34.62 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.38 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  28.31 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.18 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.32 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.43 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  28.94 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  25.37 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  30.33 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  30.33 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.89 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.93 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  27.41 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  28.05 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  26.82 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  29.25 
 
 		 356 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  28.37 
 
 		 382 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 358 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  27.84 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  25.86 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  26.54 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.54 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.71 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  27.7 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  27.57 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  27.7 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.71 
 
 		 402 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  28.48 
 
 		 383 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.71 
 
 		 402 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  25.45 
 
 		 375 aa  96.3  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  27.99 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 374 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  26.11 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 		 361 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.22 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  26.82 
 
 		 357 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 358 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  28.22 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  28.79 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  22.7 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>