More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1354 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  749    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  42.82 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  39.33 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  39.61 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  39.89 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  39.89 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  39.89 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  39.61 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  39.33 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  39.33 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  39.33 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  39.66 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  39.37 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  39.78 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  33.51 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  32.9 
 
 		 405 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  33.62 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  33.62 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  31.04 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  34.97 
 
 		 376 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  34.97 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  35.36 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  35.08 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  35.08 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  35.08 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  34.7 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  35.08 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  35.08 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  31.11 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  34.44 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  31.09 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  31.61 
 
 		 384 aa  176  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  34.83 
 
 		 361 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  32.2 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  32.2 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  31.17 
 
 		 343 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  32.25 
 
 		 354 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  29.97 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  28.78 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  28.78 
 
 		 355 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  27.94 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  27.91 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  32.42 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  28.49 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.83 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  31.85 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.47 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.08 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 345 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.41 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.71 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.61 
 
 		 352 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.16 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  24.38 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.3 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.65 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.09 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.16 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 374 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  26.8 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.16 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  29.29 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  28.07 
 
 		 357 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.38 
 
 		 374 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  27.66 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.44 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.73 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  25.92 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.16 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.44 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  23.71 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  23.86 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.73 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  25.07 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  26.84 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  25.7 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.51 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.35 
 
 		 363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  27.95 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  29.79 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  26.76 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  23.89 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  28.08 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.58 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  27.44 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>