More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0554 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  96.99 
 
 		 366 aa  695    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  707    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  39.78 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  39.51 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  35.1 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  29.63 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  27.73 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  27.43 
 
 		 366 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  30.89 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.69 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  30.22 
 
 		 351 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  28.73 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.8 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  23.93 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.42 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.59 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.85 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.01 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  27.53 
 
 		 371 aa  116  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.22 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.3 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.67 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.67 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.45 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.05 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.67 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.67 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.67 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.45 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.45 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  30.28 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  27.22 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.44 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  28.06 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1755  hypothetical protein  27.25 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.39 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  26.86 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.14 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  27.84 
 
 		 540 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.52 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.56 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  22.7 
 
 		 371 aa  99.8  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.78 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.7 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.7 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.72 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.72 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.72 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.72 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.72 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.62 
 
 		 402 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.62 
 
 		 402 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.78 
 
 		 424 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  24.72 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  27.04 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.72 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  24.72 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.72 
 
 		 376 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.72 
 
 		 376 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  24.72 
 
 		 376 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.72 
 
 		 376 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.72 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.72 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.51 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  24.62 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.79 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  24.37 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  24.53 
 
 		 357 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 		 438 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  24.14 
 
 		 394 aa  89.7  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25 
 
 		 390 aa  89.4  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.35 
 
 		 396 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.89 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  26.18 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  24.77 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  23.8 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  22.55 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  23.38 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  23.84 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  24.18 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  24.18 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  22.88 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  23.4 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  21.43 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.42 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.27 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.05 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>