More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2291 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  80.83 
 
 
435 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  841    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  49.34 
 
 
417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  38.29 
 
 
404 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 
344 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.71 
 
 
345 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  32.83 
 
 
354 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.91 
 
 
341 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  34.26 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.19 
 
 
351 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 
351 aa  133  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.63 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.56 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.56 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  29.13 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.99 
 
 
354 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.87 
 
 
405 aa  126  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  28.05 
 
 
355 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  28.05 
 
 
355 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  28.05 
 
 
355 aa  126  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  28.05 
 
 
355 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  28.05 
 
 
355 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  30.7 
 
 
374 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  29.25 
 
 
355 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  29.72 
 
 
374 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  30.5 
 
 
355 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  30.5 
 
 
355 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  29.28 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.81 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.81 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  31.95 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  30.32 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  28.12 
 
 
361 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  28.12 
 
 
361 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.81 
 
 
348 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  28.12 
 
 
348 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  28.12 
 
 
361 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  28.61 
 
 
369 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.81 
 
 
361 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
345 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.5 
 
 
373 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.63 
 
 
371 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  31.72 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  28.4 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  28.4 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  29.25 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.92 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.35 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  30.89 
 
 
363 aa  113  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  27.88 
 
 
355 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  28.53 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.36 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  31.09 
 
 
356 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  28.05 
 
 
352 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.13 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  27.62 
 
 
418 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.62 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.36 
 
 
378 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  29.33 
 
 
361 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 
340 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.98 
 
 
393 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 
349 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 
529 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.67 
 
 
373 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  26.8 
 
 
366 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.91 
 
 
354 aa  105  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  30.21 
 
 
369 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.28 
 
 
367 aa  104  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.44 
 
 
375 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.45 
 
 
376 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  30.86 
 
 
353 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.6 
 
 
349 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.53 
 
 
363 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.93 
 
 
383 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  29.04 
 
 
362 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  29.04 
 
 
355 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  29.04 
 
 
355 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.45 
 
 
373 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.03 
 
 
368 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  29.04 
 
 
362 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  23.8 
 
 
368 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  29.04 
 
 
362 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  27.39 
 
 
362 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  30.06 
 
 
361 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  24.46 
 
 
373 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.69 
 
 
373 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  29.39 
 
 
370 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  25.6 
 
 
366 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 
460 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  29.23 
 
 
382 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 
370 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.74 
 
 
358 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 
363 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  29.63 
 
 
392 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  26.38 
 
 
361 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  25.53 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  25.53 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  25.53 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.71 
 
 
372 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>