More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1113 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  52.84 
 
 		 368 aa  345  6e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  27.95 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.65 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.47 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  32.17 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  31.3 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  30.03 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.77 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.28 
 
 		 355 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  28.36 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  32.29 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  28.28 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  28.28 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  28.28 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  28.28 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  28.28 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.12 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  28.62 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  28.62 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.16 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  30.6 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  30.48 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  28.19 
 
 		 372 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 529 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  31.72 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.26 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.69 
 
 		 348 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  31.06 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.36 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  27.34 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.1 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.1 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.46 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  28.28 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.92 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.27 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  29.97 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.61 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.38 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.3 
 
 		 368 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.92 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.92 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  30.03 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.6 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.15 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.23 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.15 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.6 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  29.19 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.41 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  25.9 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.06 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.97 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  28.47 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  30.43 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.33 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  28.88 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25.93 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.12 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.09 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  27 
 
 		 345 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.09 
 
 		 367 aa  89.4  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  28.05 
 
 		 369 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  24.81 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  27.16 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  23.67 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  27.41 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  26.9 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  31.37 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  31.37 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  27.68 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.66 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  28.04 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.78 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  27.38 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  25.96 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.69 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  27.99 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  30.06 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  37.11 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.66 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.91 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  25.41 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.21 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>