More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3895 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 529 aa  1031    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  59.65 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  46.62 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  46.23 
 
 		 412 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  47.26 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  47.55 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  46.36 
 
 		 388 aa  286  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  45.09 
 
 		 357 aa  246  9e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  39.47 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  39.24 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  38.29 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  39.08 
 
 		 371 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  38.28 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 		 394 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  38.66 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  36.83 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  38.87 
 
 		 373 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 		 354 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  30.51 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  28.61 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 		 364 aa  130  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  31.47 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  28.49 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  31.07 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  31.17 
 
 		 399 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  31.6 
 
 		 414 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  32.41 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  28.29 
 
 		 563 aa  124  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  40.12 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 448 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  32.93 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.84 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  29.88 
 
 		 368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.78 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  32.48 
 
 		 347 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  34 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  34 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  34.11 
 
 		 381 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 386 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  31.27 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.6 
 
 		 370 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.65 
 
 		 343 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  29.43 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  30.42 
 
 		 348 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.25 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  27.03 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 		 420 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 		 340 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  30.56 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  34.03 
 
 		 384 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.45 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  29.19 
 
 		 345 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  29.58 
 
 		 417 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  28.16 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  29.04 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.1 
 
 		 378 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  28.7 
 
 		 363 aa  98.6  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  30.67 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  26.55 
 
 		 416 aa  98.2  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  31.11 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.13 
 
 		 348 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  27.03 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  31.85 
 
 		 367 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.6 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.59 
 
 		 415 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  24.68 
 
 		 349 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.85 
 
 		 351 aa  93.6  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  28.26 
 
 		 348 aa  93.6  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  29.68 
 
 		 421 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.5 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.13 
 
 		 383 aa  93.2  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  30.39 
 
 		 434 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.12 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  27.89 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  25.7 
 
 		 362 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.81 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.12 
 
 		 344 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  28.04 
 
 		 436 aa  92.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.85 
 
 		 388 aa  91.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.71 
 
 		 357 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  32.53 
 
 		 403 aa  90.9  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  26.18 
 
 		 377 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  27.06 
 
 		 344 aa  90.9  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  26.27 
 
 		 359 aa  90.5  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 422 aa  90.1  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.08 
 
 		 373 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.08 
 
 		 348 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  26.14 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.4 
 
 		 361 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.4 
 
 		 361 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.4 
 
 		 361 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  26.1 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  27.47 
 
 		 542 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 349 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>