More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1841 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1841  permease  100 
 
 		 563 aa  1155    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  53.72 
 
 		 526 aa  560  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  44.83 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  45.11 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  46.28 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  46.15 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  39.07 
 
 		 408 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  40.66 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  35.88 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  34.25 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 		 529 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  29.13 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  27.3 
 
 		 412 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  30.67 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 		 358 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  31.9 
 
 		 426 aa  90.1  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  30.47 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  30.47 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  26.35 
 
 		 413 aa  87  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  26.28 
 
 		 390 aa  86.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.1 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  27.59 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  27.34 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  27.24 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  27.24 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  31.37 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  24.07 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  28.21 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  27.74 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  28.63 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  32.43 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  29.3 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.33 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.65 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.59 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  27.07 
 
 		 443 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  26.39 
 
 		 407 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  25.48 
 
 		 384 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  25.53 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  26.04 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  25.84 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  33.13 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  31.5 
 
 		 390 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  28.64 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.67 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  22.91 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  33.53 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  29.85 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  23.2 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  26.04 
 
 		 425 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  22.52 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  25.49 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.15 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  26.19 
 
 		 367 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  25.15 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  27.4 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.33 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  20.73 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  26.68 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  23.23 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  24.6 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  27.86 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.33 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.33 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.33 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.33 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.17 
 
 		 348 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.19 
 
 		 361 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.19 
 
 		 361 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  23.62 
 
 		 438 aa  67  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  23.47 
 
 		 382 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  29.12 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.17 
 
 		 348 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 354 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  22.22 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.55 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  27.76 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  27.36 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  23.1 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  23.72 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  23.97 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  30.72 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  23.32 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.92 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  26.14 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  26.61 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  31.93 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  24.27 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>