More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3823 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 390 aa  738    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  49.49 
 
 		 426 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  56.96 
 
 		 376 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  55.56 
 
 		 376 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  55.56 
 
 		 376 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  57.4 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  51.69 
 
 		 444 aa  302  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  55.3 
 
 		 414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  45.01 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  45.53 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  50.63 
 
 		 476 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  38.92 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  35.81 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.18 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  36.6 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  38.29 
 
 		 455 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  34.75 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  34.86 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  41.44 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  33.02 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  34.2 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  36.07 
 
 		 452 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  34.2 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  33.94 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  38.69 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  36.31 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  41.24 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  40.79 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  37.46 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  35.96 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  36.2 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  38.6 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  34.77 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  32.46 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  37.33 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  33.65 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  34.32 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  37.44 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  37.01 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  41.64 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  39.84 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  36.71 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  36.12 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  42.7 
 
 		 393 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  33.13 
 
 		 436 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  35.07 
 
 		 477 aa  136  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  40.07 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  31.79 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  38.52 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  33.65 
 
 		 432 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  33.03 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  29.6 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  32.73 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  27.45 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.04 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  31.25 
 
 		 563 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  22.47 
 
 		 387 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.4 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.1 
 
 		 329 aa  94.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.91 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.55 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  30.91 
 
 		 448 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25.43 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.27 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  28.44 
 
 		 324 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  30.07 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  31.56 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  24.54 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.39 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  23.63 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.46 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.05 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  26.25 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  21.49 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.75 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.35 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.27 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.59 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.4 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.16 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.4 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.41 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  23.92 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.13 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.21 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.21 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.21 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>