More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7052 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 402 aa  769    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  64.24 
 
 		 403 aa  349  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  48.85 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  52.52 
 
 		 381 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  52.52 
 
 		 381 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  52.52 
 
 		 381 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  50.27 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  49.74 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  51.73 
 
 		 487 aa  315  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  50.87 
 
 		 423 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  48.4 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  45.14 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  44.66 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  44.48 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  55.1 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  48.12 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  45.28 
 
 		 421 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  45.81 
 
 		 420 aa  249  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  40.91 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  43.84 
 
 		 415 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  44.08 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  39.65 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  45.95 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  39.39 
 
 		 483 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  38.46 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  39.58 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  37.98 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  37.79 
 
 		 436 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  34.73 
 
 		 429 aa  196  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  38.23 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.36 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  39.52 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  43.24 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.62 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  38.6 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  41.75 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  37 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.28 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  39.87 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  31.19 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  33.52 
 
 		 418 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.92 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  35.11 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  36.99 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  37.75 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  34.45 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  37.36 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  37.36 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  36.51 
 
 		 393 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.17 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  28.12 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25.37 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.73 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 		 529 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  36.17 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  26.1 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  25.77 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  25.93 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  27.3 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  26.34 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  26.34 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  25.93 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  25.52 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  25.52 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  30.71 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  29.13 
 
 		 329 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  28.06 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  23.1 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.42 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  25.68 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.86 
 
 		 361 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  23.85 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 		 358 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  25.32 
 
 		 353 aa  93.2  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.68 
 
 		 355 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  24.5 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.36 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  27.52 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.14 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  29.97 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  29.07 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.94 
 
 		 383 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  27.02 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.46 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  23.47 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  30 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.06 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  23.63 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>