More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4624 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 393 aa  738    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  42.7 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  42.15 
 
 		 415 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  38.73 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  41.28 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  42.07 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  37.16 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  43.71 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  35.58 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  36.39 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  37.47 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  37.4 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  37.4 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  38.44 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  40.29 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  35.84 
 
 		 426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  40.82 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  40.82 
 
 		 487 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.93 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  42.22 
 
 		 475 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  38.41 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.13 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  35.73 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  36.07 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  40.26 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  36.39 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  36.39 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  39.66 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  36.68 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  41.67 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  40.38 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36.53 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  42.59 
 
 		 384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  35.69 
 
 		 476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  43.78 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  43.78 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  34.05 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.76 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  36.2 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  33.81 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  42.92 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  41.67 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  33.68 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  40.78 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  39.56 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  34.24 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  34.37 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  35.93 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  36.09 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  37.06 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.87 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  43.4 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  29.7 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  42.68 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  29.19 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.15 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.6 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.67 
 
 		 529 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.71 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  35.24 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 		 429 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  26.86 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  30.94 
 
 		 399 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.39 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  31.06 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  31.07 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.39 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  35.64 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  35.64 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  35.64 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.69 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  28.39 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  29.6 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  29.6 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.35 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  27.9 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  27.9 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  30.36 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  27.9 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  27.9 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  27.9 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  30.36 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  30.36 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  29.44 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  33.85 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.62 
 
 		 355 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  30.36 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  30.36 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  30.36 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  30.36 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.19 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.89 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  26.07 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.61 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  27.27 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  32.62 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  31.37 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  31.47 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>