More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0708 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 429 aa  825    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  30.36 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  34.99 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 		 354 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  30.48 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.13 
 
 		 363 aa  126  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  29.13 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 355 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  32.1 
 
 		 388 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  34.02 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  34.02 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  32.45 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  29.32 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  32.1 
 
 		 368 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  29.55 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.95 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  30.12 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  29.21 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  33.23 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  31.98 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.61 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  31.34 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  31.41 
 
 		 665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  31.67 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  28.57 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  31.52 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.49 
 
 		 343 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  30.92 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  33.43 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  32.21 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  29.81 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  31.02 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  29.46 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  28.25 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  28.8 
 
 		 379 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.69 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  31.59 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  30.03 
 
 		 547 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.95 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  28.37 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.12 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.32 
 
 		 355 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.43 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.43 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.13 
 
 		 373 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.71 
 
 		 373 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  31 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  27.87 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  27.87 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.87 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.13 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  27.87 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  29.75 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.13 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.87 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  32.82 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.13 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  29.72 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.74 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.43 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  32.61 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  28.43 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.01 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  27.27 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.83 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.83 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  32.45 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.83 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  26.16 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.83 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.27 
 
 		 398 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.88 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  28.65 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  28.65 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.82 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  32.7 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  30.84 
 
 		 487 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.74 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.82 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  28.65 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  26.93 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  29.03 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.45 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  27.67 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.38 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.55 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  31.17 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  28.34 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>