More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1950 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  764    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1689  protein of unknown function UPF0118  35.37 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.07 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.75 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.49 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  25.41 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.49 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.14 
 
 		 345 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.7 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.25 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.65 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.54 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.05 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.47 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.14 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28.24 
 
 		 384 aa  95.9  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.08 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2059  protein of unknown function UPF0118  25.39 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  26.03 
 
 		 436 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25.08 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  27.41 
 
 		 347 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 347 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  24.93 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.23 
 
 		 393 aa  93.2  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  24.37 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  23.75 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.14 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.47 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.95 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  23.1 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 429 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  22.81 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  24.12 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  26.53 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  28.51 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  22.83 
 
 		 367 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  26.85 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  25.67 
 
 		 357 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.62 
 
 		 435 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  23.5 
 
 		 418 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  26.56 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  24.38 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.12 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  29.14 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.7 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.98 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.98 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.98 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.7 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  27.06 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.98 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  23.69 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  25.72 
 
 		 805 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.98 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.7 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  23.71 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.3 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  25.17 
 
 		 547 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.98 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  25.07 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  24.13 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.72 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.87 
 
 		 349 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  25.41 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  25.41 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  22.59 
 
 		 365 aa  86.3  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.72 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.56 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  25.52 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25.47 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  24.56 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  25.84 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  24.59 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.39 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.23 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.98 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  20.45 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.67 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  23.28 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  27.02 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  24.76 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.72 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  24.84 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  30.81 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.89 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.89 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  22.32 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.89 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.89 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  22.32 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.53 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>